Antigua szigetén született, apja magasrangú angol katonatiszt, több ültetvény tulajdonosa volt. Tanulmányait Angliában végezte, a nyelvek és irodalom mellett komoly botanikai tudásra tett szert. A család közben Dél-Karolinába költözött, ahol hatalmas ültetvényeik voltak. 16 évesen apjától – akit kormányzó lett Antiguán – átvette a birtok irányítását. A politikai helyzet miatt lassan eladhatatlan rizs termelése helyett más megoldásokat keresett, indigóval kezdett próbálkozni. Kísérleti ágyásaiban több fajtával és eljárással dolgozott, külföldi botanikusokkal is levelezett.  Hamarosan nagy haszonnal eladható, kiváló minőségű kék indigó festékalapanyagot tudott piacra dobni. Eredményeit megosztotta a többi ültetvényessel, az egész állam gazdasága több évtizedre fellendült. 1744-ben házasságot kötött Charles Pinckney jogásszal, aki aktiv politikus volt.  Eliza 1793-ban Philadelphiában halt meg, temetésén egyik koporsóvivője George Washington volt. 1989-ben ő volt az első nő, akit beválasztottak a South Carolina Business Hall of Fame tagjai közé.